在蜀山区进行公司商标转让时，除了关注法律合规性和风险评估外，流程管理与后续跟进同样重要。以下是从这两个方面出发，详细阐述商标转让过程中不能忽视的问题。

一、流程管理

提交转让申请：转让方和受让方需共同向商标局提交合肥商标注册转让申请，并附上转让合同等相关材料。在提交前，需仔细核对材料的完整性和准确性，避免因材料不全或错误导致的申请被驳回。

审查与公告：商标局将对提交的转让申请进行审查，包括形式审查和实质审查。通过审查后，商标局将在官方网站上公告转让信息，接受公众的监督。在此期间，如有异议提出，商标局将按照相关程序进行处理。

核准与发证：在公告期满且无异议或异议不成立的情况下，商标局将核准商标转让并颁发新的商标注册证。受让方需及时领取并妥善保管该证书。

二、后续跟进

变更登记：商标转让获得核准后，受让方需及时办理商标变更登记手续，包括在相关机构（如工商部门）更新商标注册信息、在对外宣传中更换商标标识等。

维护商标权益：受让方需加强商标权益的维护工作，包括监测市场动态、打击侵权行为、维护商标声誉等。同时，需定期评估商标的使用价值和市场潜力，以便制定更合理的商标战略。

合同履行与监督：转让方和受让方需按照转让合同的约定履行各自的义务。如有违约行为发生，应及时采取措施予以纠正并追究违约责任。同时，双方可建立监督机制，确保合同的有效执行和商标转让的顺利进行。

税务与财务处理：商标转让涉及一定的税务和财务问题。双方需按照相关税法规定进行税务处理，并妥善记录相关财务信息。如有需要，可聘请专业税务师或会计师提供咨询和协助。

综上所述，蜀山区公司在进行商标转让时，需全面关注法律合规性、风险评估、流程管理和后续跟进等多个方面的问题。只有做好这些工作，才能确保商标转让的顺利进行和商标权益的有效维护。